本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_025383
当前查询版本OH1004
位置Chr05:110890783-110892490 (-)
描述Similar to RF2b: Transcription factor RF2b (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_025383 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38900 转录因子,作为生殖发育、分生组织大小和植物生长的抑制因子。
At2g21230 转录因子,作为生殖发育、分生组织大小和植物生长的抑制因子。
At2g31370 推测具有激活作用的转录因子。 暂无已核实直接文献
At2g40620 可能与 bZIP34 一起参与花粉发育的配子体控制的转录因子。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0336200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010628positive regulation of gene expression生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.089; 覆盖度=92.181; E 值=2.16e-96; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010629negative regulation of gene expression生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.089; 覆盖度=92.181; E 值=2.16e-96; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090567reproductive shoot system development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005654nucleoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.041; 覆盖度=25.309; E 值=4.44e-43; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048471perinuclear region of cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.041; 覆盖度=25.309; E 值=4.44e-43; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000976transcription cis-regulatory region binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.165; 覆盖度=27.366; E 值=3.02e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031490chromatin DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.041; 覆盖度=25.309; E 值=4.44e-43; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042803protein homodimerization activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0043565sequence-specific DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G21230KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.089; 覆盖度=92.181; E 值=2.16e-96UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G31370KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.909; 覆盖度=56.584; E 值=1.66e-43UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G40620KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.041; 覆盖度=25.309; E 值=4.44e-43UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G38900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.348; 覆盖度=108.642; E 值=1.65e-122UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os03g0336200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.165; 覆盖度=27.366; E 值=3.02e-46UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release