基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025124 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:106458160-106459563 (+) |
| 描述 | Similar to UGD1: UDP-glucose 6-dehydrogenase 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025124 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g26570 |
参与 UDP-葡萄糖醛酸 (UDP-GlcA) 的生物合成,为细胞壁多聚物提供核苷酸糖。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g39320 |
参与 UDP-葡萄糖醛酸 (UDP-GlcA) 的生物合成,为细胞壁多聚物提供核苷酸糖。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0443500 |
参与 UDP-葡萄糖醛酸 (UDP-GlcA) 的生物合成,为细胞壁多聚物提供核苷酸糖。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0757900 |
参与 UDP-葡萄糖醛酸 (UDP-GlcA) 的生物合成,为细胞壁多聚物提供核苷酸糖。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006024 | glycosaminoglycan biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006065 | UDP-glucuronate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003979 | UDP-glucose 6-dehydrogenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051287 | NAD binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G26570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.942; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G39320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=81.72; 覆盖度=99.572; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0757900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=81.156; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0443500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=81.37; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:548074 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=82.655; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |