基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024878 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:101424927-101427685 (+) |
| 描述 | Similar to SPA15: Senescence-associated protein SPA15%2C chloroplastic (Ipomoea batatas OX%3D4120) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024878 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g66330 |
参与调节红氧稳态以控制植物发育过程中由年龄和应激因素介导的叶片衰老。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0148700 |
可能参与叶片衰老的调控。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010150 | leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.58; 覆盖度=89.07; E 值=5.02e-176; UniProt GO evidence=TAS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.044; 覆盖度=84.419; E 值=1.27e-154; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034599 | cellular response to oxidative stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.58; 覆盖度=89.07; E 值=5.02e-176; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0072593 | reactive oxygen species metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.044; 覆盖度=84.419; E 值=1.27e-154; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.58; 覆盖度=89.07; E 值=5.02e-176; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G66330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.044; 覆盖度=84.419; E 值=1.27e-154 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0148700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.538; 覆盖度=87.674; E 值=1.4e-151 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |