基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024723 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:97445597-97448236 (+) |
| 描述 | Similar to WOX8: WUSCHEL-related homeobox 8 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024723 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g35550 |
转录因子参与果实图案的调节。 | |
At1g20700 |
在TDR/PXY受体激酶下游与WOX4具有冗余作用,调控维管组织中原形成层细胞增殖和分化,与在维管中的任何作用无关。 | |
At1g20710 |
潜在的转录因子,在发育过程中起核心作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g18010 |
可能参与发育过程的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0818400 |
可能参与发育过程的转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.394; 覆盖度=96.169; E 值=4.88e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.394; 覆盖度=96.169; E 值=4.88e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010047 | fruit dehiscence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.909; 覆盖度=105.364; E 值=1.84e-72; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010072 | primary shoot apical meristem specification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.857; 覆盖度=67.05; E 值=1.68e-54; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010087 | phloem or xylem histogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.857; 覆盖度=67.05; E 值=1.68e-54; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.857; 覆盖度=67.05; E 值=1.68e-54; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0099402 | plant organ development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.387; 覆盖度=23.755; E 值=7.36e-14; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990058 | fruit replum development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.909; 覆盖度=105.364; E 值=1.84e-72; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.394; 覆盖度=96.169; E 值=4.88e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.909; 覆盖度=105.364; E 值=1.84e-72; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.394; 覆盖度=96.169; E 值=4.88e-80; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.394; 覆盖度=96.169; E 值=4.88e-80; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G20700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.857; 覆盖度=67.05; E 值=1.68e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G20710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.828; 覆盖度=77.778; E 值=6.31e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G18010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=48.387; 覆盖度=23.755; E 值=7.36e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G35550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.909; 覆盖度=105.364; E 值=1.84e-72 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0818400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=51.394; 覆盖度=96.169; E 值=4.88e-80 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |