基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024603 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:94944526-94948147 (-) |
| 描述 | Similar to SAMT: Salicylate carboxymethyltransferase (Clarkia breweri OX%3D36903) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024603 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g36470 |
参与独脚金内酯生物合成的甲基转移酶;独脚金内酯通过促进与土壤微生物的互作并抑制分枝,提高植物适应性。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0031408 | oxylipin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.617; 覆盖度=102.732; E 值=3.46e-94; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032259 | methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.242; 覆盖度=95.902; E 值=3.22e-168; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901601 | strigolactone biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.892; 覆盖度=100.82; E 值=2.33e-159; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000032 | regulation of secondary shoot formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.892; 覆盖度=100.82; E 值=2.33e-159; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.892; 覆盖度=100.82; E 值=2.33e-159; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.617; 覆盖度=102.732; E 值=3.46e-94; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008168 | methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.935; 覆盖度=101.639; E 值=9.96e-94; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008757 | S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.242; 覆盖度=95.902; E 值=3.22e-168; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030795 | methyl jasmonate methylesterase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.617; 覆盖度=102.732; E 值=3.46e-94; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=65.242; 覆盖度=95.902; E 值=3.22e-168; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ag:AAF00108 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=41.935; 覆盖度=101.639; E 值=9.96e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G36470 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.892; 覆盖度=100.82; E 值=2.33e-159 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |