基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024451 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:91036003-91037271 (-) |
| 描述 | Similar to IAA8: Auxin-responsive protein IAA8 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024451 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g22670 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g65670 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g29080 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g14550 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0601300 |
Aux/IAA 蛋白是短命转录因子,在低生长素浓度下充当早期生长素响应基因的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=64.881; 覆盖度=53.333; E 值=2.29e-66; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009733 | response to auxin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009734 | auxin-activated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010102 | lateral root morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.593; 覆盖度=80.317; E 值=4.32e-66; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901332 | negative regulation of lateral root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IMP:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IDA:CACAO | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.416; 覆盖度=97.778; E 值=9.47e-115; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G22670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=60.714; 覆盖度=97.778; E 值=2.75e-117 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G14550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.593; 覆盖度=80.317; E 值=4.32e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G29080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=51.447; 覆盖度=98.73; E 值=8.55e-92 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G65670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.416; 覆盖度=97.778; E 值=9.47e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0601300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=64.881; 覆盖度=53.333; E 值=2.29e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |