基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024403 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:89683105-89686295 (-) |
| 描述 | Similar to SHR: Protein SHORT-ROOT (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_024403 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g37650 |
转录因子，参与静止中心细胞的特化以及周围干细胞的维持，并参与根部径向模式形成过程中非对称细胞分裂。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2YN56 |
转录因子，参与根部放射状模式形成的非对称细胞分裂所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
Os07g0586900 |
转录因子，参与根部放射状模式形成的非对称细胞分裂所必需。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0433200 |
推测的转录因子，参与不对称细胞分裂。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2XIA8 |
推测的转录因子，参与不对称细胞分裂。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008356 | asymmetric cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009956 | radial pattern formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032350 | regulation of hormone metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=NAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045930 | negative regulation of mitotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048366 | leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0060586 | multicellular organismal-level iron ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005769 | early endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005770 | late endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055037 | recycling endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043565 | sequence-specific DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G37650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=57.195; 覆盖度=88.691; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0433200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.757; 覆盖度=84.491; E 值=6.14e-141 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0586900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.757; 覆盖度=97.092; E 值=4.49e-154 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |