基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024360 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:88466575-88467516 (+) |
| 描述 | Similar to IRX15: Protein IRREGULAR XYLEM 15 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024360 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g50220 |
木聚糖生物合成所需,但不直接参与催化将糖添加到生长的聚合物中。 | |
At5g67210 |
木聚糖生物合成所需,但不直接参与催化将糖添加到生长的聚合物中。 | |
At1g09610 |
甲基转移酶催化木聚糖上葡萄糖醛酸侧链的 4-O-甲基化。 | |
At1g33800 |
甲基转移酶催化木聚糖上葡萄糖醛酸侧链的 4-O-甲基化。 | |
At1g67330 |
参与不同植物细胞壁成分的葡萄糖醛酸甲基化,但主要在阿拉伯半乳聚糖的侧链上。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005976 | polysaccharide metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.909; 覆盖度=68.99; E 值=6.96e-42; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006479 | protein methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.944; 覆盖度=100.348; E 值=1.3e-41; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009808 | lignin metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.909; 覆盖度=68.99; E 值=6.96e-42; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009827 | plant-type cell wall modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.944; 覆盖度=100.348; E 值=1.3e-41; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009834 | plant-type secondary cell wall biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.062; 覆盖度=111.498; E 值=2.99e-113; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032259 | methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.821; 覆盖度=93.38; E 值=2.14e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045491 | xylan metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.821; 覆盖度=93.38; E 值=2.14e-46; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045492 | xylan biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.062; 覆盖度=111.498; E 值=2.99e-113; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.062; 覆盖度=111.498; E 值=2.99e-113; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.821; 覆盖度=93.38; E 值=2.14e-46; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.909; 覆盖度=68.99; E 值=6.96e-42; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.944; 覆盖度=100.348; E 值=1.3e-41; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.062; 覆盖度=111.498; E 值=2.99e-113; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005802 | trans-Golgi network | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.944; 覆盖度=100.348; E 值=1.3e-41; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030775 | glucuronoxylan 4-O-methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.821; 覆盖度=93.38; E 值=2.14e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G09610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.821; 覆盖度=93.38; E 值=2.14e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G33800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.909; 覆盖度=68.99; E 值=6.96e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G67330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.944; 覆盖度=100.348; E 值=1.3e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G50220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.062; 覆盖度=111.498; E 值=2.99e-113 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G67210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.116; 覆盖度=105.575; E 值=4.51e-112 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |