基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_024281 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:86340916-86341997 (+) |
| 描述 | Similar to REM14: B3 domain-containing protein REM14 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_024281 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g24645 |
含 B3 域的蛋白 REM14。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g18990 |
必需蛋白质。 | |
At4g31690 |
含B3结构域的蛋白REM9。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g49480 |
参与春化作用的调控(通过相似性)。 | |
At1g26680 |
含 B3 结构域的蛋白质 REM17。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.868; 覆盖度=94.186; E 值=1.24e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.941; 覆盖度=91.86; E 值=2.11e-09; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009909 | regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.69; 覆盖度=55.039; E 值=1.92e-10; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010048 | vernalization response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.69; 覆盖度=55.039; E 值=1.92e-10; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.868; 覆盖度=94.186; E 值=1.24e-10; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.69; 覆盖度=55.039; E 值=1.92e-10; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.927; 覆盖度=53.101; E 值=7.55e-09; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.868; 覆盖度=94.186; E 值=1.24e-10; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.941; 覆盖度=91.86; E 值=2.11e-09; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.69; 覆盖度=55.039; E 值=1.92e-10; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.868; 覆盖度=94.186; E 值=1.24e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G26680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.439; 覆盖度=88.372; E 值=5.68e-08 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G49480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.927; 覆盖度=53.101; E 值=7.55e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G24645 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=23.868; 覆盖度=94.186; E 值=1.24e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G18990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.69; 覆盖度=55.039; E 值=1.92e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G31690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=21.941; 覆盖度=91.86; E 值=2.11e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |