基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_023429 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:39668377-39669640 (-) |
| 描述 | Similar to FKBP13: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP13%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_023429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g45680 |
PPIases 加速蛋白质折叠。 |
Profound redox sensitivity of peptidyl-prolyl isomerase activity in Arabidopsis thylakoid lumen.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.05.054
|
At4g39710 |
NDH经由FMN和铁硫(Fe-S)中心,将NAD(P)H的电子传递至光合电子传递链中的质体醌,并可能参与叶绿体呼吸链。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.045; 覆盖度=69.778; E 值=3.78e-45; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.045; 覆盖度=69.778; E 值=3.78e-45; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.045; 覆盖度=69.778; E 值=3.78e-45; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009543 | chloroplast thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79; UniProt GO evidence=HDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.045; 覆盖度=69.778; E 值=3.78e-45; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031977 | thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003755 | peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G39710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.045; 覆盖度=69.778; E 值=3.78e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G45680 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.75; 覆盖度=71.111; E 值=1.15e-79 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ddi:DDB_G0282267 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.961; 覆盖度=45.333; E 值=1.83e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | kla:KLLA0_C01045g | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=51.515; 覆盖度=44.0; E 值=3.1e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nma:NMA0273 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.903; 覆盖度=50.222; E 值=1.15e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |