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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_023257
当前查询版本OH1004
位置Chr05:29044509-29051970 (-)
描述Similar to At1g22220: F-box protein At1g22220 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_023257 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g22220 SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分,可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At1g30200 F-box蛋白At1g30200。 暂无已核实直接文献
At5g46170 F-box蛋白 At5g46170。 暂无已核实直接文献
At4g18380 F-盒蛋白 At4g18380。 暂无已核实直接文献
At1g78100 SCF(ASK- Cullin-F-box) E3泛素连接酶复合物的组分,可能介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解(通过相似性)。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009736cytokinin-activated signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=23.154; 覆盖度=55.288; E 值=8.92e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010286heat acclimation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.004; 覆盖度=42.486; E 值=1.22e-13; UniProt GO evidence=IEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010540basipetal auxin transport生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=23.154; 覆盖度=55.288; E 值=8.92e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010541acropetal auxin transport生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=23.154; 覆盖度=55.288; E 值=8.92e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.24; 覆盖度=51.763; E 值=2.53e-15; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0071456cellular response to hypoxia生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.24; 覆盖度=51.763; E 值=2.53e-15; UniProt GO evidence=HEP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.24; 覆盖度=51.763; E 值=2.53e-15; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009506plasmodesma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.24; 覆盖度=51.763; E 值=2.53e-15; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.683; 覆盖度=37.477; E 值=5.49e-14; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G22220KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=27.24; 覆盖度=51.763; E 值=2.53e-15UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G30200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.683; 覆盖度=37.477; E 值=5.49e-14UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G78100KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=23.154; 覆盖度=55.288; E 值=8.92e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G18380KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.884; 覆盖度=38.404; E 值=2.02e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G46170KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.004; 覆盖度=42.486; E 值=1.22e-13UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release