基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022418 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:149860349-149863037 (+) |
| 描述 | Similar to GA2OX6: Gibberellin 2-beta-dioxygenase 6 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022418 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g21200 |
催化赤霉素 前体的 2-β-羟基化,使其无法转化为活性 GA。 | |
At1g50960 |
催化赤霉素 (GA) 前体的 2-β-羟基化,使其无法转化为活性 GA。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0522500 |
催化几种生物活性赤霉素的 2-β-羟基化,导致其内源水平的稳态调节。 | |
Os07g0103500 |
催化多种生物活性赤霉素(GAs)的 2-β 羟基化,进而调节其内源水平的稳态。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009651 | response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.071; 覆盖度=98.534; E 值=4.1e-81; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009685 | gibberellin metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.693; 覆盖度=95.601; E 值=2.56e-120; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009686 | gibberellin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.693; 覆盖度=95.601; E 值=2.56e-120; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010336 | gibberellic acid homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045487 | gibberellin catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.071; 覆盖度=98.534; E 值=4.1e-81; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016706 | 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.693; 覆盖度=95.601; E 值=2.56e-120; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045543 | gibberellin 2-beta-dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051213 | dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.439; 覆盖度=92.082; E 值=1.87e-49; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G50960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=41.071; 覆盖度=98.534; E 值=4.1e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G21200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.693; 覆盖度=95.601; E 值=2.56e-120 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0522500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0103500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.132; 覆盖度=102.346; E 值=1.36e-104 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4336431 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.623; 覆盖度=101.173; E 值=3.44e-123 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4342182 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.132; 覆盖度=102.346; E 值=1.36e-104 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |