基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022404 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:149587574-149599731 (+) |
| 描述 | Similar to SCPL34: Serine carboxypeptidase-like 34 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022404 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g23210 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g08260 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g30610 |
活性丝氨酸羧肽酶,具有广泛的底物偏好,包括碱性基团和亲水基团。 | |
At2g24010 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0158500 |
通过控制谷粒宽度、灌浆和重量,作为谷粒大小的正向调节因子。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.594; 覆盖度=92.713; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.753; 覆盖度=94.13; E 值=2.38e-165; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.594; 覆盖度=92.713; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.594; 覆盖度=92.713; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005615 | extracellular space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.753; 覆盖度=94.13; E 值=2.38e-165; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.594; 覆盖度=92.713; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004185 | serine-type carboxypeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.594; 覆盖度=92.713; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G24010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.113; 覆盖度=89.271; E 值=1.98e-162 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G30610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.753; 覆盖度=94.13; E 值=2.38e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G08260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.183; 覆盖度=92.713; E 值=3.46e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G23210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.594; 覆盖度=92.713; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0158500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.893; 覆盖度=90.891; E 值=3.93e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4337873 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.893; 覆盖度=90.891; E 值=3.93e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |