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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_022289
当前查询版本OH1004
位置Chr04:147628342-147631876 (+)
描述Similar to At1g12700: Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12700%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022289 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12700 推测的含五三螺旋重复蛋白 At1g12700,线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g12300 含五螺旋肽重复的蛋白 At1g12300,线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g12775 含五肽重复的蛋白 At1g12775,线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g62930 含有五百四十肽重复的蛋白 At1g62930,叶绿体。 暂无已核实直接文献
At1g62910 含五百四十肽重复的蛋白 At1g62910。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006396RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.227; 覆盖度=55.115; E 值=1.68e-120; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0080156mitochondrial mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.227; 覆盖度=55.115; E 值=1.68e-120; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090615mitochondrial mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.5; 覆盖度=65.473; E 值=1.57e-113; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.227; 覆盖度=55.115; E 值=1.68e-120; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.227; 覆盖度=55.115; E 值=1.68e-120; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.5; 覆盖度=65.473; E 值=1.57e-113; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G12300KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.5; 覆盖度=65.473; E 值=1.57e-113UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G12700KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.227; 覆盖度=55.115; E 值=1.68e-120UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release