基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022248 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:146787289-146787958 (-) |
| 描述 | Similar to IDM3: Increased DNA methylation 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022248 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g20870 |
作为抗沉默因子,可防止 DNA 高甲基化和基因抑制。 | |
At1g54850 |
含α-晶状体结构域的蛋白 22.3。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g54840 |
防止 DNA 高甲基化以及转基因和某些内源基因的转录沉默。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006338 | chromatin remodeling | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.774; 覆盖度=60.92; E 值=4.18e-31; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.704; 覆盖度=97.126; E 值=3.09e-49; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.704; 覆盖度=97.126; E 值=3.09e-49; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.774; 覆盖度=60.92; E 值=4.18e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.721; 覆盖度=70.115; E 值=8.33e-35; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.774; 覆盖度=60.92; E 值=4.18e-31; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G20870 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.704; 覆盖度=97.126; E 值=3.09e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G54840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.774; 覆盖度=60.92; E 值=4.18e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G54850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.721; 覆盖度=70.115; E 值=8.33e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |