基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022147 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:145296374-145299509 (+) |
| 描述 | Similar to BASS4: Probable sodium/metabolite cotransporter BASS4%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022147 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g56160 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0531200 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B8AJ09 |
可能作为钠偶联代谢物运输体在叶绿体外膜上发挥功能。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006814 | sodium ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006874 | intracellular calcium ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030210 | heparin proteoglycan biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.544; 覆盖度=78.44; E 值=4.39e-145; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.544; 覆盖度=78.44; E 值=4.39e-145; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.544; 覆盖度=78.44; E 值=4.39e-145; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015293 | symporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G56160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.544; 覆盖度=78.44; E 值=4.39e-145 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0531200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.0; 覆盖度=81.422; E 值=5.32e-133 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:84068 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.25; 覆盖度=73.394; E 值=2.89e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | xla:100337583 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.907; 覆盖度=69.037; E 值=5.67e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |