基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021929 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:140584671-140585791 (+) |
| 描述 | Similar to EXPA3: Expansin-A3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021929 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g37640 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g39700 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g02260 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g28950 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g55500 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006949 | syncytium formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=NAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009828 | plant-type cell wall loosening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010114 | response to red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.4; 覆盖度=96.899; E 值=1.08e-152; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.4; 覆盖度=96.899; E 值=1.08e-152; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G28950 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=82.258; 覆盖度=96.124; E 值=3.97e-150 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G37640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=80.952; 覆盖度=97.674; E 值=6.4e-154 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G39700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=80.4; 覆盖度=96.899; E 值=1.08e-152 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G55500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=78.4; 覆盖度=96.899; E 值=2.14e-147 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G02260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=79.116; 覆盖度=96.512; E 值=3.98e-151 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |