基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021730 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:135971424-135975254 (-) |
| 描述 | Similar to At5g62370: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g62370 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021730 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g62370 |
含五重复肽序列的蛋白 At5g62370。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g61990 |
含五重复肽序列蛋白 At5g61990,线粒体。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g65560 |
含五基重复肽结构蛋白 At5g65560。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g59900 |
推测的五肽重复蛋白(pentatricopeptide repeat-containing protein)At5g59900。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g12100 |
含五肽重复序列的蛋白质 At5g12100,线粒体。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006396 | RNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.061; 覆盖度=79.57; E 值=2.97e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007005 | mitochondrion organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.061; 覆盖度=79.57; E 值=2.97e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.979; 覆盖度=91.887; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.979; 覆盖度=91.887; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G61990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.061; 覆盖度=79.57; E 值=2.97e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G62370 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.979; 覆盖度=91.887; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |