基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021396 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:128722867-128723512 (-) |
| 描述 | Similar to RIBA1: Bifunctional riboflavin biosynthesis protein RIBA 1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021396 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g64300 |
参与核黄素生物合成。 | |
At5g59750 |
参与核黄素生物合成。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0481950 |
参与核黄素生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0572400 |
参与核黄素生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0460600 |
参与核黄素生物合成。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009231 | riboflavin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.794; 覆盖度=36.842; E 值=1.54e-11; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003935 | GTP cyclohydrolase II activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005525 | GTP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008686 | 3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G59750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=50.794; 覆盖度=36.842; E 值=1.54e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G64300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.968; 覆盖度=36.842; E 值=2.36e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0572400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=90.323; 覆盖度=18.129; E 值=2.32e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0460600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=83.871; 覆盖度=18.129; E 值=7.95e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |