基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021186 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:123788488-123790655 (+) |
| 描述 | Similar to TIFY6B: Protein TIFY 6B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021186 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g17860 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | |
At1g48500 |
茉莉酸反应的抑制因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g70700 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0401300 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
Os08g0428400 |
茉莉酸反应的阻遏物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.842; 覆盖度=110.545; E 值=3.95e-26; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009611 | response to wounding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009753 | response to jasmonic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.948; 覆盖度=98.545; E 值=2.58e-25; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009861 | jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.842; 覆盖度=110.545; E 值=3.95e-26; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009867 | jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031347 | regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000022 | regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30; UniProt GO evidence=IPI:IntAct | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G48500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.842; 覆盖度=110.545; E 值=3.95e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G70700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=33.948; 覆盖度=98.545; E 值=2.58e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G17860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.706; 覆盖度=123.636; E 值=1.74e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0428400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=37.705; 覆盖度=66.545; E 值=3.67e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0401300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.894; 覆盖度=68.364; E 值=9.59e-22 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |