RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_021074
当前查询版本OH1004
位置Chr04:120654942-120659430 (+)
描述Similar to PCMP-H28: Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g21065 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_021074 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21065 含五聚肽重复的蛋白质 At4g21065。 暂无已核实直接文献
At1g59720 参与叶绿体中多个位点的RNA编辑事件。
Pentatricopeptide repeat proteins with the DYW motif have distinct molecular functions in RNA editing and RNA cleavage in Arabidopsis chloroplasts.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.064667
At5g48910 含五次肽重复序列的蛋白At5g48910。 暂无已核实直接文献
At2g02980 参与叶绿体中的RNA编辑事件。
A study of new Arabidopsis chloroplast RNA editing mutants reveals general features of editing factors and their target sites.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.071472
At5g66520 含五肽重复序列的蛋白 At5g66520。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.53; 覆盖度=75.569; E 值=1.5e-86; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009451RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.362; 覆盖度=73.748; E 值=2.08e-88; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016554cytidine to uridine editing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.814; 覆盖度=78.3; E 值=3.28e-81; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016556mRNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.53; 覆盖度=75.569; E 值=1.5e-86; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031425chloroplast RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.753; 覆盖度=73.596; E 值=1.84e-83; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1900865chloroplast RNA modification生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.814; 覆盖度=78.3; E 值=3.28e-81; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.362; 覆盖度=73.748; E 值=2.08e-88; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.362; 覆盖度=73.748; E 值=2.08e-88; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.362; 覆盖度=73.748; E 值=2.08e-88; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.648; 覆盖度=81.032; E 值=1.93e-84; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004519endonuclease activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.53; 覆盖度=75.569; E 值=1.5e-86; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.362; 覆盖度=73.748; E 值=2.08e-88; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G59720KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.53; 覆盖度=75.569; E 值=1.5e-86UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G02980KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.753; 覆盖度=73.596; E 值=1.84e-83UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G21065KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=34.362; 覆盖度=73.748; E 值=2.08e-88UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G48910KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.648; 覆盖度=81.032; E 值=1.93e-84UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G66520KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.814; 覆盖度=78.3; E 值=3.28e-81UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release