基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_021072 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:120621147-120623294 (+) |
| 描述 | Similar to ADT2: Arogenate dehydratase/prephenate dehydratase 2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_021072 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g07630 |
将莽草酸-分支酸途径产生的预苯酯转化为苯丙氨酸。 | |
At1g11790 |
将莽草酸-分支酸途径产生的预苯酯转化为苯丙氨酸。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007623 | circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.043; 覆盖度=84.514; E 值=1.96e-131; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009094 | L-phenylalanine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.585; 覆盖度=106.824; E 值=2.4e-171; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010020 | chloroplast fission | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.5; 覆盖度=83.99; E 值=1.46e-159; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.5; 覆盖度=83.99; E 值=1.46e-159; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.585; 覆盖度=106.824; E 值=2.4e-171; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.585; 覆盖度=106.824; E 值=2.4e-171; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010319 | stromule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.5; 覆盖度=83.99; E 值=1.46e-159; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004664 | prephenate dehydratase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.585; 覆盖度=106.824; E 值=2.4e-171; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0047769 | arogenate dehydratase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.585; 覆盖度=106.824; E 值=2.4e-171; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G11790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.063; 覆盖度=83.465; E 值=9.67e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G07630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=72.5; 覆盖度=83.99; E 值=1.46e-159 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |