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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_020004
当前查询版本OH1004
位置Chr04:47263720-47264493 (-)
描述Similar to ATL41: E3 ubiquitin-protein ligase ATL41 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020004 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g42360 E3泛素蛋白连接酶，能够与泛素结合酶E2 UBC8、UBC10、UBC11、UBC28、UBC29、UBC30、UBC35和UBC36在体外催化多泛素化反应。 暂无已核实直接文献
At2g42350 RING-H2指蛋白ATL40。 暂无已核实直接文献
At3g16720 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献
At3g62690 RING-H2 指蛋白 ATL5。 暂无已核实直接文献
At1g20823 可能参与植物防御信号通路的早期阶段。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006952defense response生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.522; 覆盖度=107.393; E 值=1.35e-27; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009909regulation of flower development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.811; 覆盖度=57.588; E 值=4.82e-20; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010966regulation of phosphate transport生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.811; 覆盖度=57.588; E 值=4.82e-20; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.569; 覆盖度=99.222; E 值=8.5e-47; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0065003protein-containing complex assembly生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.324; 覆盖度=55.253; E 值=1.29e-20; UniProt GO evidence=TAS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0070417cellular response to cold生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.811; 覆盖度=57.588; E 值=4.82e-20; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.538; 覆盖度=101.167; E 值=9.16e-35; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.811; 覆盖度=57.588; E 值=4.82e-20; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.811; 覆盖度=57.588; E 值=4.82e-20; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016020membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.569; 覆盖度=99.222; E 值=8.5e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004842ubiquitin-protein transferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.569; 覆盖度=99.222; E 值=8.5e-47; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.569; 覆盖度=99.222; E 值=8.5e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.569; 覆盖度=99.222; E 值=8.5e-47; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061659ubiquitin-like protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.324; 覆盖度=55.253; E 值=1.29e-20; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G20823KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.811; 覆盖度=57.588; E 值=4.82e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G42350KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.538; 覆盖度=101.167; E 值=9.16e-35UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G42360KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.569; 覆盖度=99.222; E 值=8.5e-47UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G16720KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.522; 覆盖度=107.393; E 值=1.35e-27UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G62690KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=37.324; 覆盖度=55.253; E 值=1.29e-20UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release