基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_019074 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:23140111-23141474 (-) |
| 描述 | Similar to PEX13: Peroxisomal membrane protein 13 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_019074 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 1 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g07560 |
PEX13-PEX14 对接复合体的组分,一种转位通道,专门介导结合 PEX5 受体的过氧化物酶体货物蛋白的导入。 |
The Arabidopsis pex12 and pex13 mutants are defective in both PTS1- and PTS2-dependent protein transport to peroxisomes.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02809.x
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006635 | fatty acid beta-oxidation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.142; 覆盖度=42.761; E 值=8.91e-48; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016558 | protein import into peroxisome matrix | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.142; 覆盖度=42.761; E 值=8.91e-48; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016560 | protein import into peroxisome matrix, docking | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.142; 覆盖度=42.761; E 值=8.91e-48; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005778 | peroxisomal membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.142; 覆盖度=42.761; E 值=8.91e-48; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990429 | peroxisomal importomer complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.142; 覆盖度=42.761; E 值=8.91e-48; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G07560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.142; 覆盖度=42.761; E 值=8.91e-48 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |