基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018688 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:16672467-16674126 (-) |
| 描述 | Similar to PANC: Pantoate--beta-alanine ligase (Lotus japonicus OX%3D34305) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018688 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g48840 |
催化泛酸与β-丙氨酸的缩合反应以形成泛酸。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0851800 |
催化泛酸与β-丙氨酸的缩合反应以形成泛酸。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.617; 覆盖度=96.396; E 值=7.47e-144; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015940 | pantothenate biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.009; 覆盖度=95.796; E 值=3.71e-145; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.617; 覆盖度=96.396; E 值=7.47e-144; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.009; 覆盖度=95.796; E 值=3.71e-145; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004592 | pantoate-beta-alanine ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.009; 覆盖度=95.796; E 值=3.71e-145; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.009; 覆盖度=95.796; E 值=3.71e-145; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=63.804; 覆盖度=97.898; E 值=2.49e-144; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G48840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=62.617; 覆盖度=96.396; E 值=7.47e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cth:Cthe_0901 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=42.138; 覆盖度=95.495; E 值=1.91e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0851800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=63.804; 覆盖度=97.898; E 值=2.49e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | trq:TRQ2_1740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.409; 覆盖度=93.994; E 值=6.16e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |