基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018429 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:12768634-12769938 (-) |
| 描述 | Similar to Os03g0137200: Probable protein phosphatase 2C 28 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018429 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g38520 |
对质膜H⁺-ATP酶(PM H⁺-ATP酶,例如AHA1和AHA2)去磷酸化并抑制,从而负向影响植物生长和适应性。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g66080 |
可能去磷酸化并抑制质膜H⁺-ATP酶(PM H⁺-ATP酶,例如AHA1和AHA2),从而对植物生长和适应性产生负面影响。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0137200 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 28。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0761100 |
可能的蛋白磷酸酶2C 34。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q5MFV5 |
可能的蛋白磷酸酶2C 34。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:1900036 | positive regulation of cellular response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.348; 覆盖度=41.516; E 值=1.41e-17; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902531 | regulation of intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.87e-18; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.33e-17; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.348; 覆盖度=41.516; E 值=1.41e-17; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.87e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.87e-18; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.87e-18; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G38520 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.33e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G66080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=44.348; 覆盖度=41.516; E 值=1.41e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0137200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.87e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0761100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=25.795; 覆盖度=102.166; E 值=5.85e-17 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4331548 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.237; 覆盖度=85.199; E 值=1.87e-18 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |