基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018251 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:9510617-9514302 (+) |
| 描述 | Similar to QRT2: Polygalacturonase QRT2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018251 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g07970 |
细胞类型特异性果胶降解以分离小孢子所需的多聚半乳糖醛酸酶。 | |
At3g57510 |
多聚半乳糖醛酸酶参与荚果破碎最后阶段的细胞分离和花药开裂。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005975 | carbohydrate metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.237; 覆盖度=93.269; E 值=1.49e-97; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009830 | cell wall modification involved in abscission | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009835 | fruit ripening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.237; 覆盖度=93.269; E 值=1.49e-97; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009901 | anther dehiscence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010047 | fruit dehiscence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045490 | pectin catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048235 | pollen sperm cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.216; 覆盖度=98.077; E 值=7.71e-94; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004650 | polygalacturonase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G07970 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.216; 覆盖度=91.106; E 值=8.7e-98 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G57510 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.216; 覆盖度=98.077; E 值=7.71e-94 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |