基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018125 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:6982108-6983617 (-) |
| 描述 | Similar to WRKY32: Probable WRKY transcription factor 32 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018125 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g30935 |
转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g07100 |
转录因子。 | |
At3g01080 |
转录因子。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g30250 |
转录因子。 |
Functional characterization of Arabidopsis NaCl-inducible WRKY25 and WRKY33 transcription factors in abiotic stresses.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9408-3
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0826400 |
可能参与脱落酸和赤霉素信号的转录调控。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034605 | cellular response to heat | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.455; 覆盖度=53.125; E 值=2.11e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0070370 | cellular heat acclimation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.455; 覆盖度=53.125; E 值=2.11e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G30935 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.309; 覆盖度=84.659; E 值=4.36e-68 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G07100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.455; 覆盖度=53.125; E 值=2.11e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |