基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017892 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:2943325-2944244 (-) |
| 描述 | Similar to VP22-1: Vacuolar protein sorting-associated protein 22 homolog 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017892 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g27040 |
负责运输的内体分选复合体II(ESCRT-II)的组分,参与多泡体(MVB)形成及将内体货蛋白分选入MVB。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g05850 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 | |
At3g11330 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0476700 |
富含亮氨酸的重复蛋白,可能在信号转导的背景下介导蛋白质相互作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.959; 覆盖度=56.069; E 值=1.97e-07; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009555 | pollen development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.0; 覆盖度=57.803; E 值=1.36e-20; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035556 | intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.0; 覆盖度=57.803; E 值=1.36e-20; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043328 | protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.219; 覆盖度=73.988; E 值=2.82e-26; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055046 | microgametogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.0; 覆盖度=57.803; E 值=1.36e-20; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000814 | ESCRT II complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.219; 覆盖度=73.988; E 值=2.82e-26; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.219; 覆盖度=73.988; E 值=2.82e-26; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.741; 覆盖度=62.428; E 值=5.97e-19; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.0; 覆盖度=57.803; E 值=1.36e-20; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.741; 覆盖度=62.428; E 值=5.97e-19; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G11330 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.741; 覆盖度=62.428; E 值=5.97e-19 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G27040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.219; 覆盖度=73.988; E 值=2.82e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G05850 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.0; 覆盖度=57.803; E 值=1.36e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0476700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=31.959; 覆盖度=56.069; E 值=1.97e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |