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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_017382
当前查询版本OH1004
位置Chr03:147917462-147918607 (-)
描述Similar to DRT100: DNA damage-repair/toleration protein DRT100 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017382 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12610 该蛋白能够补偿细菌 recA 突变,但其在植物中的本体功能尚不清楚。 暂无已核实直接文献
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
At3g24240 与 RGI2、RGI3、RGI4 和 RGI5 一起,作为 RGF 肽(如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN)的受体,这些肽激素通过调控转录因子 PLETHORA(PLT,例如 PLT1 和 PLT2)的表达水平和模式来维持胚后根干细胞的生态位。

水稻

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006281DNA repair生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0007165signal transduction生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=IC:TIGRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009742brassinosteroid mediated signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090696post-embryonic plant organ development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000166nucleotide binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004672protein kinase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:InterProUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005524ATP binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G12610KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os04g0576900KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGosa:4336741KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release