基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017382 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:147917462-147918607 (-) |
| 描述 | Similar to DRT100: DNA damage-repair/toleration protein DRT100 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_017382 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g12610 |
该蛋白能够补偿细菌 recA 突变,但其在植物中的本体功能尚不清楚。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g20140 |
与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。 |
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
|
At3g24240 |
与 RGI2、RGI3、RGI4 和 RGI5 一起,作为 RGF 肽(如 RGF1、GLV5/CLEL1/RGF2、GLV7/CLEL3/RGF3、GLV3/RGF4、GLV10/CLEL7/RGF5 和 RGF10/CLELN)的受体,这些肽激素通过调控转录因子 PLETHORA(PLT,例如 PLT1 和 PLT2)的表达水平和模式来维持胚后根干细胞的生态位。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0576900 |
在器官发育的早期阶段通过调节细胞分裂速率发挥功能。 | |
Os07g0568700 |
真菌多半乳糖醛酸酶抑制剂。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006281 | DNA repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=IC:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090696 | post-embryonic plant organ development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000166 | nucleotide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004672 | protein kinase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G12610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=32.934; 覆盖度=87.664; E 值=1.17e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0576900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4336741 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.168; 覆盖度=68.766; E 值=4.17e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |