基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_017373 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:147741696-147744577 (+) |
| 描述 | Similar to At3g19440: RNA pseudouridine synthase 4%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_017373 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0520100 |
线粒体 RNA 假尿嘧啶合成酶 3。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0103500 |
RNA假尿苷合成酶4，线粒体型。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000455 | enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.942; 覆盖度=100.626; E 值=2.4e-157; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.801; 覆盖度=83.925; E 值=1.44e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.942; 覆盖度=100.626; E 值=2.4e-157; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.942; 覆盖度=100.626; E 值=2.4e-157; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.942; 覆盖度=100.626; E 值=2.4e-157; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009982 | pseudouridine synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.942; 覆盖度=100.626; E 值=2.4e-157; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160141 | 23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.597; 覆盖度=60.125; E 值=4.71e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G78910 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.801; 覆盖度=83.925; E 值=1.44e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G19440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.942; 覆盖度=100.626; E 值=2.4e-157 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0520100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.73; 覆盖度=82.046; E 值=2.62e-99 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0103500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.135; 覆盖度=55.532; E 值=2.64e-92 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rty:RT0249 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.597; 覆盖度=60.125; E 值=4.71e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |