基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016970 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:138159776-138162557 (+) |
| 描述 | Similar to BC1L6: COBRA-like protein 1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016970 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0604300 |
参与决定细胞扩张方向,可能通过在纤维素沉积中起重要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
Os03g0416300 |
COBRA样蛋白2。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0386800 |
参与决定细胞扩张方向,可能通过在纤维素沉积中起重要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010215 | cellulose microfibril organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.489; 覆盖度=102.552; E 值=5.21e-169; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052324 | plant-type cell wall cellulose biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.489; 覆盖度=102.552; E 值=5.21e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.489; 覆盖度=102.552; E 值=5.21e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.269; 覆盖度=99.072; E 值=4.11e-166; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098552 | side of membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.489; 覆盖度=102.552; E 值=5.21e-169; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G09790 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.269; 覆盖度=99.072; E 值=4.11e-166 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G02210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=50.909; 覆盖度=102.088; E 值=1.98e-160 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0416300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=54.545; 覆盖度=96.984; E 值=1.74e-162 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0386800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=53.023; 覆盖度=99.768; E 值=1.61e-161 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0604300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.489; 覆盖度=102.552; E 值=5.21e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |