基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016102 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:110317423-110319399 (+) |
| 描述 | Similar to At1g16220: Probable protein phosphatase 2C 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016102 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g16220 |
可能的蛋白磷酸酶 2C 6。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g79630 |
可能的蛋白磷酸酶2C 18。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g02750 |
可能的蛋白磷酸酶2C 33。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0500300 |
可能的蛋白质磷酸酶2C 66。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0417400 |
可能的蛋白磷酸酶2C 75。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:1902531 | regulation of intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.158; 覆盖度=106.022; E 值=3e-175; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.438; 覆盖度=109.462; E 值=2.73e-169; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.438; 覆盖度=109.462; E 值=2.73e-169; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004722 | protein serine/threonine phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.158; 覆盖度=106.022; E 值=3e-175; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.158; 覆盖度=106.022; E 值=3e-175; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G16220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.158; 覆盖度=106.022; E 值=3e-175 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G79630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.438; 覆盖度=109.462; E 值=2.73e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G02750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=51.126; 覆盖度=95.484; E 值=2.03e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0500300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=56.803; 覆盖度=99.57; E 值=1.22e-164 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0417400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.261; 覆盖度=87.312; E 值=6.38e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |