基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016006 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:103087487-103088679 (-) |
| 描述 | Similar to TATA: Sec-independent protein translocase protein TATA%2C chloroplastic (Pisum sativum OX%3D3888) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016006 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g28750 |
双精氨酸转运(Tat)系统的一部分,该系统将包含特征性双精氨酸基序的折叠大蛋白通过类囊体膜转运。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0634000 |
双精氨酸转运(Tat)系统的一部分,该系统将包含特征性双精氨酸基序的折叠大蛋白通过类囊体膜转运。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006886 | intracellular protein transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.143; 覆盖度=41.722; E 值=8.74e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032594 | protein transport within lipid bilayer | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.909; 覆盖度=72.848; E 值=2.92e-34; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043953 | protein transport by the Tat complex | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.111; 覆盖度=59.603; E 值=5.9e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045038 | protein import into chloroplast thylakoid membrane | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.111; 覆盖度=59.603; E 值=5.9e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.909; 覆盖度=72.848; E 值=2.92e-34; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.111; 覆盖度=59.603; E 值=5.9e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.909; 覆盖度=72.848; E 值=2.92e-34; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.909; 覆盖度=72.848; E 值=2.92e-34; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033281 | TAT protein transport complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.111; 覆盖度=59.603; E 值=5.9e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042651 | thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.111; 覆盖度=59.603; E 值=5.9e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008320 | protein transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.143; 覆盖度=41.722; E 值=8.74e-20; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009977 | proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.111; 覆盖度=59.603; E 值=5.9e-38; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G28750 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.909; 覆盖度=72.848; E 值=2.92e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0634000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=63.736; 覆盖度=60.265; E 值=2.3e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr1046 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.143; 覆盖度=41.722; E 值=8.74e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:541788 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.182; 覆盖度=58.278; E 值=3.76e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |