基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_014894 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:59151720-59153636 (+) |
| 描述 | Similar to U2AF35A: Splicing factor U2af small subunit A (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014894 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g42820 |
对前mRNA的剪接是必需的(按相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g27650 |
对前mRNA的剪接是必需的(按相似性)。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os09g0491756 |
前体 mRNA 剪接所必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
Os05g0564200 |
前体 mRNA 剪接所必需的。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000398 | mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048573 | photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.99; 覆盖度=96.959; E 值=5.71e-128; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005681 | spliceosomal complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.921; 覆盖度=68.243; E 值=5.28e-84; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016607 | nuclear speck | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.99; 覆盖度=96.959; E 值=5.71e-128; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0089701 | U2AF complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030628 | pre-mRNA 3'-splice site binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G27650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.783; 覆盖度=96.622; E 值=2.6e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G42820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.99; 覆盖度=96.959; E 值=5.71e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0564200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=80.541; 覆盖度=62.5; E 值=1.95e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0491756 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.361; 覆盖度=97.297; E 值=3.34e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:361542 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.921; 覆盖度=68.243; E 值=5.28e-84 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |