基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_014689 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:55017715-55019872 (+) |
| 描述 | Similar to P39: Outer envelope protein 39%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_014689 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g44160 |
具有电压依赖性通道活性的β桶状孔形成蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g48620 |
可能在质体发育过程中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g19620 |
在质体发育早期阶段发挥关键作用。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2X208 |
叶绿体外包膜蛋白80。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0196300 |
叶绿体外包膜蛋白80。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=34.392; 覆盖度=97.172; E 值=5.12e-62; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030162 | regulation of proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900057 | positive regulation of leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901002 | positive regulation of response to salt stress | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.656; 覆盖度=97.172; E 值=9.91e-63; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009707 | chloroplast outer membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.656; 覆盖度=97.172; E 值=9.91e-63; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032991 | protein-containing complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015267 | channel activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031625 | ubiquitin protein ligase binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G44160 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.838; 覆盖度=100.0; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G48620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.271; 覆盖度=82.519; E 值=4.98e-99 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G19620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=34.656; 覆盖度=97.172; E 值=9.91e-63 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0196300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=34.656; 覆盖度=97.172; E 值=1.69e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |