基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013930 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:38303647-38306029 (+) |
| 描述 | Similar to DAO: 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase DAO (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_013930 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 17 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g38240 |
2-氧代戊二酸依赖双加氧酶,参与茉莉酸(JA)的氧化,JA 是一种应激诱导的植物激素,在病原体和草食性动物攻击时合成,通过 JA 介导的信号通路触发防御反应的激活。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0475600 |
依赖2-氧代戊二酸的双加氧酶,对于生长素分解代谢及生殖器官中生长素稳态维持至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q01IX6 |
依赖2-氧代戊二酸的双加氧酶,对于生长素分解代谢及生殖器官中生长素稳态维持至关重要。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002238 | response to molecule of fungal origin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.646; 覆盖度=89.773; E 值=5.98e-32; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009805 | coumarin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.646; 覆盖度=89.773; E 值=5.98e-32; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009852 | auxin catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.333; 覆盖度=85.227; E 值=4.18e-103; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042617 | paclitaxel biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.724; 覆盖度=82.386; E 值=1.47e-36; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900150 | regulation of defense response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1900366 | negative regulation of defense response to insect | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000022 | regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.724; 覆盖度=82.386; E 值=1.47e-36; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016491 | oxidoreductase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.724; 覆盖度=82.386; E 值=1.47e-36; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016706 | 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.333; 覆盖度=85.227; E 值=4.18e-103; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.333; 覆盖度=85.227; E 值=4.18e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051213 | dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.333; 覆盖度=85.227; E 值=4.18e-103; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0120091 | jasmonic acid hydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G38240 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.55; 覆盖度=84.659; E 值=2.16e-32 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0475600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.333; 覆盖度=85.227; E 值=4.18e-103 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |