基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_013252 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:26615972-26618014 (-) |
| 描述 | Similar to LPE1: Protein LOW PHOTOSYNTHETIC EFFICIENCY 1%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_013252 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g46610 |
通过与光依赖的机制结合 PSII 亚基 mRNA（如 psbJ、psbN 和 psbA）的 5' 非翻译区，参与光调控的光系统 II (PSII) 生物发生和基粒类囊体形成，并促进 HCF173 与目标 mRNA 的结合，这些 mRNA 编码 PSII 反应中心蛋白（如 J、N 和 D1），从而通过调节核糖体加载调控其表达。 | |
At1g63080 |
含五十二肽重复的线粒体蛋白At1g63080。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g62930 |
含有五百四十肽重复的蛋白 At1g62930，叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g09900 |
含五重复肽结构蛋白 At1g09900。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.121; 覆盖度=76.324; E 值=2.05e-28; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006413 | translational initiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010207 | photosystem II assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032544 | plastid translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008494 | translation activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043022 | ribosome binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G62930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=23.121; 覆盖度=76.324; E 值=2.05e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G63080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=21.682; 覆盖度=78.676; E 值=5.45e-29 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G46610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.935; 覆盖度=99.118; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |