基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012393 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:11542355-11543548 (+) |
| 描述 | Similar to LRX6: Leucine-rich repeat extensin-like protein 6 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012393 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g22800 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g13340 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g24480 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g18670 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g12040 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000902 | cell morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.224; 覆盖度=88.917; E 值=1.41e-133; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.224; 覆盖度=88.917; E 值=1.41e-133; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010054 | trichoblast differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.224; 覆盖度=88.917; E 值=1.41e-133; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.89; 覆盖度=82.368; E 值=1.44e-156; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.677; 覆盖度=84.131; E 值=6.35e-146; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.286; 覆盖度=81.108; E 值=1.78e-144; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.677; 覆盖度=84.131; E 值=6.35e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.677; 覆盖度=84.131; E 值=6.35e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0099503 | secretory vesicle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.286; 覆盖度=81.108; E 值=1.78e-144; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005199 | structural constituent of cell wall | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.89; 覆盖度=82.368; E 值=1.44e-156; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042277 | peptide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.286; 覆盖度=81.108; E 值=1.78e-144; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G12040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=57.224; 覆盖度=88.917; E 值=1.41e-133 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G22800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.89; 覆盖度=82.368; E 值=1.44e-156 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G24480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.677; 覆盖度=84.131; E 值=6.35e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G13340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.286; 覆盖度=81.108; E 值=1.78e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G18670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.515; 覆盖度=83.123; E 值=5.16e-136 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |