基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012381 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:11418269-11420052 (+) |
| 描述 | Similar to RCA: Ribulose bisphosphate carboxylase/oxygenase activase%2C chloroplastic (Malus domestica OX%3D3750) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012381 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
当前来源表未检出该物种的同源命中。
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0707000 |
RuBisCO(核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶;EC 4.1.1.39)的激活涉及赖氨酸ε-氨基的ATP依赖性羧化,形成羧酸铵结构。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.086; 覆盖度=95.043; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.086; 覆盖度=95.043; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.086; 覆盖度=95.043; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016887 | ATP hydrolysis activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.086; 覆盖度=95.043; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046863 | ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.086; 覆盖度=95.043; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | dosa:Os11g0707000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=80.831; 覆盖度=93.319; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mdm:103456062 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=82.086; 覆盖度=95.043; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | vra:106757684 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=83.532; 覆盖度=90.302; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |