基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_011773 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:14149-19121 (+) |
| 描述 | Similar to 4-coumarate--CoA ligase 2 (Glycine max OX%3D3847) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011773 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g65060 |
产生多种羟基和甲氧基取代的肉桂酸酰基辅酶A,这些化合物用于合成多种来源于苯丙烷的化合物,包括花青素、类黄酮、异黄酮、香豆素、木质素、木栓质和壁结合的酚类化合物。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0697400 |
通过介导多种羟基肉桂酸的活化参与苯丙烷代谢,用于单木酚和其他酚类次级代谢物的生物合成。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009411 | response to UV | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009698 | phenylpropanoid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.752; 覆盖度=91.252; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010584 | pollen exine formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.752; 覆盖度=91.252; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016207 | 4-coumarate-CoA ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.752; 覆盖度=91.252; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016405 | CoA-ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=62.731; 覆盖度=92.967; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050563 | trans-feruloyl-CoA synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106286 | (E)-caffeate-CoA ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:RHEA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106290 | trans-cinnamate-CoA ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G65060 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=71.963; 覆盖度=91.767; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0697400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.392; 覆盖度=92.796; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gmx:547930 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.752; 覆盖度=91.252; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | nta:107803673 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=62.731; 覆盖度=92.967; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |