RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_010252
当前查询版本OH1004
位置Chr02:143147792-143148601 (+)
描述Similar to DOF4.4: Dof zinc finger protein DOF4.4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010252 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21050 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献
At4g38000 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。
Overexpression of AtDOF4.7, an Arabidopsis DOF family transcription factor, induces floral organ abscission deficiency in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.153247
At3g45610 转录因子，负向影响种子萌发，并在调控一组特定的与脱落酸相关基因中拮抗 TCP14 功能。
Arabidopsis thaliana DOF6 negatively affects germination in non-after-ripened seeds and interacts with TCP14.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err388
Mobile PEAR transcription factors integrate positional cues to prime cambial growth.2019 · DOI: 10.1038/s41586-018-0839-y
At1g21340 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g51700 能特异性结合5'-AA[AG]G-3'共识核心序列的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006351DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006355regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=TAS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010154fruit development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010227floral organ abscission生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.692; 覆盖度=28.996; E 值=4.13e-25; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0045893positive regulation of DNA-templated transcription生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0090057root radial pattern formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.222; 覆盖度=33.457; E 值=1.12e-24; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:2000032regulation of secondary shoot formation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000976transcription cis-regulatory region binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.222; 覆盖度=33.457; E 值=1.12e-24; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003677DNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003700DNA-binding transcription factor activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G21340KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.526; 覆盖度=28.253; E 值=3.16e-24UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G51700KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.972; 覆盖度=26.394; E 值=2.72e-24UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G45610KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=52.222; 覆盖度=33.457; E 值=1.12e-24UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G21050KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.201; 覆盖度=73.978; E 值=1.39e-28UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT4G38000KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=57.692; 覆盖度=28.996; E 值=4.13e-25UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release