本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_010071
当前查询版本OH1004
位置Chr02:139359417-139360643 (+)
描述Similar to PPR336: Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g61870%2C mitochondrial (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_010071 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g61870 可能通过与多核糖体的关联参与翻译。 暂无已核实直接文献
At1g11630 含五重复肽重复蛋白 At1g11630,线粒体。 暂无已核实直接文献
At1g55890 小核糖体亚单位蛋白 mS78 (rPPR3a)。 暂无已核实直接文献
At3g13160 小核糖体亚基蛋白 mS79 (rPPR3b)。 暂无已核实直接文献
At4g36680 小核糖体亚基蛋白mL103(rPPR7)。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006396RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.177; 覆盖度=88.725; E 值=1.89e-51; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0007005mitochondrion organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.177; 覆盖度=88.725; E 值=1.89e-51; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005743mitochondrial inner membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.065; 覆盖度=89.951; E 值=5.59e-50; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005840ribosome细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1990904ribonucleoprotein complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000166nucleotide binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G11630KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=53.439; 覆盖度=92.647; E 值=1.41e-138UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G55890KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.177; 覆盖度=88.725; E 值=1.89e-51UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G61870KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.724; 覆盖度=100.245; E 值=3.69e-163UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G13160KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.065; 覆盖度=89.951; E 值=5.59e-50UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release