基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009795 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:133543042-133544330 (-) |
| 描述 | Similar to TE1: Protein terminal ear1 (Zea mays OX%3D4577) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009795 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g61960 |
可能的RNA结合转录激活因子,在减数分裂和营养生长中起作用。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g07290 |
可能的RNA结合蛋白,在减数分裂和营养生长中发挥作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: A2WY46 |
可能的RNA结合蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
Os01g0907900 |
可能的RNA结合蛋白。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000381 | regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.482; 覆盖度=48.432; E 值=4.52e-36; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.649; 覆盖度=38.676; E 值=2.53e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045836 | positive regulation of meiotic nuclear division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.299; 覆盖度=46.69; E 值=1.19e-25; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045927 | positive regulation of growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.299; 覆盖度=46.69; E 值=1.19e-25; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051321 | meiotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.649; 覆盖度=38.676; E 值=2.53e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.649; 覆盖度=38.676; E 值=2.53e-27; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016607 | nuclear speck | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.482; 覆盖度=48.432; E 值=4.52e-36; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.889; 覆盖度=47.038; E 值=2.33e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.482; 覆盖度=48.432; E 值=4.52e-36; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G07290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.299; 覆盖度=46.69; E 值=1.19e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G61960 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=48.649; 覆盖度=38.676; E 值=2.53e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0907900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.889; 覆盖度=47.038; E 值=2.74e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:541683 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.482; 覆盖度=48.432; E 值=4.52e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |