基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_009763 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:132838460-132839745 (+) |
| 描述 | Similar to CYCD6-1: Putative cyclin-D6-1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_009763 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g03270 |
假定环素-D6-1。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g70210 |
可能激活根分生组织 (RAM) 的细胞周期,并促进胚根(胚轴根)伸出。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g65420 |
可能激活根分生组织 (RAM) 的细胞周期,并促进胚根(胚轴根)伸出。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0556000 |
细胞周期蛋白D6-1。 | 暂无已核实直接文献 |
Os09g0382300 |
细胞周期蛋白D2-1。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000082 | G1/S transition of mitotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009744 | response to sucrose | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.148; 覆盖度=90.301; E 值=3.09e-20; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010440 | stomatal lineage progression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.148; 覆盖度=90.301; E 值=3.09e-20; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051301 | cell division | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000307 | cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016538 | cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G70210 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.5; 覆盖度=66.89; E 值=7.25e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G03270 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=40.385; 覆盖度=104.348; E 值=4.31e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G65420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=28.148; 覆盖度=90.301; E 值=3.09e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0556000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.228; 覆盖度=95.318; E 值=4.02e-36 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os09g0382300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.122; 覆盖度=65.552; E 值=5.7e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |