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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_008538
当前查询版本OH1004
位置Chr02:102148073-102150399 (-)
描述Similar to CPT1: Coleoptile phototropism protein 1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008538 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03250 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g48800 可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献
At5g64330 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
Arabidopsis NPH3: A NPH1 photoreceptor-interacting protein essential for phototropism.1999 · DOI: 10.1126/science.286.5441.961
RPT2. A signal transducer of the phototropic response in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.2.225
RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE 1 is a phototropin 1 binding protein required for phototropism.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603799103
The Arabidopsis PHYTOCHROME KINASE SUBSTRATE2 protein is a phototropin signaling element that regulates leaf flattening and leaf positioning.2010 · DOI: 10.1104/pp.109.150441
At5g67385 可能作为E3泛素蛋白连接酶复合体（CUL3-RBX1-BTB）的底物特异性衔接蛋白，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0568200 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。
The Rice COLEOPTILE PHOTOTROPISM1 gene encoding an ortholog of Arabidopsis NPH3 is required for phototropism of coleoptiles and lateral translocation of auxin.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.028357

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009638phototropism生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.639; 覆盖度=87.26; E 值=2.35e-58; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009785blue light signaling pathway生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.639; 覆盖度=87.26; E 值=2.35e-58; UniProt GO evidence=IPI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016567protein ubiquitination生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.391; 覆盖度=82.933; E 值=1.58e-64; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathwayUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.676; 覆盖度=88.942; E 值=3.66e-60; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005886plasma membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.639; 覆盖度=87.26; E 值=2.35e-58; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G03250KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=35.676; 覆盖度=88.942; E 值=3.66e-60UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G48800KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=35.23; 覆盖度=88.702; E 值=5.05e-59UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G64330KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.639; 覆盖度=87.26; E 值=2.35e-58UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os02g0568200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=37.391; 覆盖度=82.933; E 值=1.58e-64UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release