基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_007667 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:55663899-55666461 (-) |
| 描述 | Similar to ATAB2: Protein TAB2 homolog%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_007667 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g08010 |
核基因组编码的富含 A/U 的 RNA 结合蛋白,参与光系统 I 和 II 的生物发生。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os02g0610800 |
核基因组编码的因子,参与光系统I(PSI)的生物发生。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006629 | lipid metabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.397; 覆盖度=80.977; E 值=6.97e-153; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009704 | de-etiolation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035556 | intracellular signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.397; 覆盖度=80.977; E 值=6.97e-153; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048564 | photosystem I assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004435 | phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate phospholipase C activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.397; 覆盖度=80.977; E 值=6.97e-153; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G08010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.347; 覆盖度=100.771; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0610800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=66.772; 覆盖度=81.234; E 值=2.67e-154 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100284484 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=65.397; 覆盖度=80.977; E 值=6.97e-153 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |