基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_007519 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:51213905-51224953 (+) |
| 描述 | Similar to CPSF160: Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_007519 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g51660 |
CPSF 在前 mRNA 3' 端形成中起关键作用，识别 AAUAAA 信号序列，并与多聚腺苷酸聚合酶及其他因子相互作用，实现剪切和加尾多聚腺苷酸。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0252200 |
CPSF 在前 mRNA 3' 端形成中起关键作用，识别 AAUAAA 信号序列，并与多聚腺苷酸聚合酶及其他因子相互作用，实现剪切和加尾多聚腺苷酸。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.211; 覆盖度=64.276; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031124 | mRNA 3'-end processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54; UniProt GO evidence=IDA:ComplexPortal | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0180012 | co-transcriptional RNA 3'-end processing, cleavage and polyadenylation pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54; UniProt GO evidence=IC:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.211; 覆盖度=64.276; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005654 | nucleoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54; UniProt GO evidence=IDA:HPA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005847 | mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.211; 覆盖度=64.276; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019899 | enzyme binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035925 | mRNA 3'-UTR AU-rich region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G51660 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.211; 覆盖度=64.276; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:29894 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=31.169; 覆盖度=62.517; E 值=1.88e-54 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |