基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_006304 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:6457623-6460276 (-) |
| 描述 | Similar to EXPA1: Expansin-A1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006304 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g69530 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g03090 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g29030 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g26770 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g56320 |
通过破坏纤维素微纤维和基质葡聚糖之间的非共价键,导致植物细胞壁松弛和延伸。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006949 | syncytium formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009826 | unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=NAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009828 | plant-type cell wall loosening | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009831 | plant-type cell wall modification involved in multidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010114 | response to red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010119 | regulation of stomatal movement | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=71.084; 覆盖度=104.184; E 值=3.04e-123; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0080022 | primary root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=72.835; 覆盖度=106.276; E 值=1.06e-126; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005199 | structural constituent of cell wall | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=74.494; 覆盖度=103.347; E 值=1.06e-124; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G26770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=74.494; 覆盖度=103.347; E 值=1.06e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G69530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.829; 覆盖度=102.929; E 值=8.3e-132 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G03090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=74.297; 覆盖度=104.184; E 值=2.78e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G29030 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=72.835; 覆盖度=106.276; E 值=1.06e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G56320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=71.084; 覆盖度=104.184; E 值=3.04e-123 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |