RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_006166
当前查询版本OH1004
位置Chr02:2972443-2976770 (-)
描述Similar to DEGP9: Protease Do-like 9 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006166 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 16 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g40200 能降解双组分应答调节蛋白 ARR4 的丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At2g47940 丝氨酸蛋白酶，可对植物光系统 II 中光损伤的 D1 蛋白进行初级裂解。
A chloroplast DegP2 protease performs the primary cleavage of the photodamaged D1 protein in plant photosystem II.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.4.713
At5g36950 可能的丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At1g65630 推测丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At1g65640 推测丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006508proteolysis生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.296; 覆盖度=103.866; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009658chloroplast organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010206photosystem II repair生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0030163protein catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.296; 覆盖度=103.866; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005730nucleolus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.296; 覆盖度=103.866; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005759mitochondrial matrix细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.604; 覆盖度=95.958; E 值=4.31e-153; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009533chloroplast stromal thylakoid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009535chloroplast thylakoid membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009941chloroplast envelope细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174; UniProt GO evidence=HDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031966mitochondrial membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.323; 覆盖度=80.492; E 值=4.56e-125; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0004252serine-type endopeptidase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.296; 覆盖度=103.866; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008236serine-type peptidase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.296; 覆盖度=103.866; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G65630KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.708; 覆盖度=81.371; E 值=2.67e-131UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G65640KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.323; 覆盖度=80.492; E 值=4.56e-125UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT2G47940KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.814; 覆盖度=81.195; E 值=4.18e-174UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G36950KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=45.604; 覆盖度=95.958; E 值=4.31e-153UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G40200KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=75.296; 覆盖度=103.866; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release